Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MECP2P51608 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MECP2P51608 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MECP2P51608 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MECP2P51608 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MECP2P51608 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MECP2P51608 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MECP2P51608 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MECP2P51608 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MECP2P51608 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MECP2P51608 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MECP2P51608 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MECP2P51608 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MECP2P51608 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MECP2P51608 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MECP2P51608 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MECP2P51608 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MECP2P51608 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MECP2P51608 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MECP2P51608 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MECP2P51608 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MECP2P51608 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MECP2P51608 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MECP2P51608 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MECP2P51608 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MECP2P51608 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MECP2P51608 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MECP2P51608 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MECP2P51608 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MECP2P51608 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MECP2P51608 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MECP2P51608 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MECP2P51608 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MECP2P51608 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MECP2P51608 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MECP2P51608 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MECP2P51608 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MECP2P51608 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MECP2P51608 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MECP2P51608 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MECP2P51608 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MECP2P51608 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MECP2P51608 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MECP2P51608 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MECP2P51608 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MECP2P51608 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MECP2P51608 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MECP2P51608 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MECP2P51608 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MECP2P51608 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MECP2P51608 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MECP2P51608 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MECP2P51608 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MECP2P51608 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MECP2P51608 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MECP2P51608 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MECP2P51608 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MECP2P51608 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MECP2P51608 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MECP2P51608 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MECP2P51608 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MECP2P51608 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MECP2P51608 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MECP2P51608 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MECP2P51608 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MECP2P51608 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MECP2P51608 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MECP2P51608 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MECP2P51608 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MECP2P51608 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MECP2P51608 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MECP2P51608 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MECP2P51608 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MECP2P51608 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MECP2P51608 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MECP2P51608 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MECP2P51608 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MECP2P51608 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MECP2P51608 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MECP2P51608 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MECP2P51608 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MECP2P51608 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MECP2P51608 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MECP2P51608 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MECP2P51608 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MECP2P51608 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MECP2P51608 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MECP2P51608 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MECP2P51608 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MECP2P51608 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MECP2P51608 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MECP2P51608 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MECP2P51608 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms