Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASCL1P50553 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASCL1P50553 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASCL1P50553 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL1P50553 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL1P50553 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms