Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF6P49848 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF6P49848 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF6P49848 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF6P49848 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF6P49848 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF6P49848 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF6P49848 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF6P49848 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF6P49848 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF6P49848 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF6P49848 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF6P49848 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF6P49848 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF6P49848 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF6P49848 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF6P49848 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF6P49848 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF6P49848 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF6P49848 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF6P49848 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF6P49848 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF6P49848 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF6P49848 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF6P49848 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF6P49848 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF6P49848 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF6P49848 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF6P49848 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF6P49848 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF6P49848 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF6P49848 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF6P49848 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF6P49848 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF6P49848 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF6P49848 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF6P49848 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF6P49848 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF6P49848 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF6P49848 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF6P49848 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF6P49848 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF6P49848 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF6P49848 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF6P49848 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF6P49848 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF6P49848 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF6P49848 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF6P49848 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF6P49848 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF6P49848 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF6P49848 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF6P49848 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF6P49848 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF6P49848 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF6P49848 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF6P49848 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF6P49848 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF6P49848 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF6P49848 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF6P49848 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF6P49848 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF6P49848 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF6P49848 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF6P49848 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF6P49848 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF6P49848 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF6P49848 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF6P49848 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF6P49848 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF6P49848 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF6P49848 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF6P49848 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF6P49848 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF6P49848 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF6P49848 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF6P49848 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF6P49848 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF6P49848 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF6P49848 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF6P49848 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF6P49848 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF6P49848 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF6P49848 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF6P49848 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF6P49848 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF6P49848 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF6P49848 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF6P49848 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF6P49848 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF6P49848 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF6P49848 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF6P49848 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF6P49848 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF6P49848 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF6P49848 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF6P49848 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF6P49848 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF6P49848 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF6P49848 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms