Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RARRES1P49788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RARRES1P49788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RARRES1P49788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARRES1P49788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARRES1P49788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARRES1P49788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARRES1P49788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms