Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRPC1P48995 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPC1P48995 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC1P48995 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC1P48995 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRPC1P48995 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms