Protein–RNA interactions for Protein: P48634

PRRC2A, Protein PRRC2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2AP48634 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC2AP48634 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRC2AP48634 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRRC2AP48634 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRRC2AP48634 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRC2AP48634 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC2AP48634 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC2AP48634 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC2AP48634 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRC2AP48634 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms