Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTSKP43235 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTSKP43235 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTSKP43235 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTSKP43235 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTSKP43235 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTSKP43235 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTSKP43235 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSKP43235 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSKP43235 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSKP43235 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSKP43235 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSKP43235 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSKP43235 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSKP43235 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSKP43235 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSKP43235 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSKP43235 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSKP43235 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSKP43235 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSKP43235 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSKP43235 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSKP43235 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSKP43235 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSKP43235 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSKP43235 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSKP43235 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSKP43235 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSKP43235 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSKP43235 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSKP43235 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSKP43235 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSKP43235 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTSKP43235 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTSKP43235 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSKP43235 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSKP43235 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSKP43235 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTSKP43235 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTSKP43235 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSKP43235 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTSKP43235 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSKP43235 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSKP43235 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSKP43235 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSKP43235 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSKP43235 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSKP43235 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSKP43235 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSKP43235 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSKP43235 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSKP43235 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSKP43235 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSKP43235 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSKP43235 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSKP43235 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSKP43235 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSKP43235 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSKP43235 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSKP43235 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSKP43235 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSKP43235 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSKP43235 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSKP43235 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSKP43235 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSKP43235 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSKP43235 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSKP43235 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSKP43235 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSKP43235 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSKP43235 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSKP43235 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTSKP43235 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTSKP43235 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTSKP43235 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTSKP43235 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTSKP43235 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTSKP43235 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTSKP43235 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSKP43235 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSKP43235 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSKP43235 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSKP43235 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSKP43235 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSKP43235 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSKP43235 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSKP43235 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSKP43235 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTSKP43235 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTSKP43235 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms