Protein–RNA interactions for Protein: P37173

TGFBR2, TGF-beta receptor type-2, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR2P37173 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TGFBR2P37173 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGFBR2P37173 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR2P37173 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR2P37173 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR2P37173 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms