Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPRR1AP35321 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR1AP35321 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1AP35321 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms