Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TM4SF1P30408 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TM4SF1P30408 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TM4SF1P30408 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TM4SF1P30408 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TM4SF1P30408 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TM4SF1P30408 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TM4SF1P30408 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms