Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPAP23025 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPAP23025 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
XPAP23025 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPAP23025 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPAP23025 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPAP23025 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPAP23025 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPAP23025 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPAP23025 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPAP23025 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPAP23025 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XPAP23025 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPAP23025 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPAP23025 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPAP23025 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPAP23025 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPAP23025 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPAP23025 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPAP23025 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPAP23025 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XPAP23025 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPAP23025 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPAP23025 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPAP23025 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPAP23025 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPAP23025 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPAP23025 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPAP23025 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPAP23025 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPAP23025 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPAP23025 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPAP23025 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPAP23025 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XPAP23025 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPAP23025 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPAP23025 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPAP23025 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPAP23025 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPAP23025 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPAP23025 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPAP23025 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPAP23025 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPAP23025 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPAP23025 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPAP23025 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPAP23025 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XPAP23025 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPAP23025 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XPAP23025 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPAP23025 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPAP23025 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPAP23025 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPAP23025 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPAP23025 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPAP23025 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPAP23025 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPAP23025 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPAP23025 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
XPAP23025 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPAP23025 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPAP23025 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPAP23025 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPAP23025 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPAP23025 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPAP23025 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPAP23025 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPAP23025 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPAP23025 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPAP23025 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPAP23025 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPAP23025 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPAP23025 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPAP23025 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPAP23025 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPAP23025 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPAP23025 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPAP23025 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPAP23025 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPAP23025 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPAP23025 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPAP23025 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPAP23025 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPAP23025 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPAP23025 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPAP23025 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPAP23025 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPAP23025 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPAP23025 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPAP23025 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPAP23025 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPAP23025 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPAP23025 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPAP23025 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPAP23025 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPAP23025 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPAP23025 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPAP23025 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPAP23025 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPAP23025 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms