Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRM1P11229 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRM1P11229 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRM1P11229 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHRM1P11229 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRM1P11229 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms