Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI3P10071 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI3P10071 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI3P10071 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI3P10071 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GLI3P10071 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI3P10071 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI3P10071 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI3P10071 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI3P10071 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI3P10071 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI3P10071 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI3P10071 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI3P10071 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI3P10071 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI3P10071 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI3P10071 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GLI3P10071 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GLI3P10071 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI3P10071 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI3P10071 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI3P10071 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI3P10071 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
GLI3P10071 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI3P10071 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GLI3P10071 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GLI3P10071 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
GLI3P10071 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
GLI3P10071 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GLI3P10071 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GLI3P10071 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GLI3P10071 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GLI3P10071 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GLI3P10071 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GLI3P10071 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GLI3P10071 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GLI3P10071 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GLI3P10071 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GLI3P10071 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GLI3P10071 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GLI3P10071 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GLI3P10071 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GLI3P10071 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GLI3P10071 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GLI3P10071 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GLI3P10071 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GLI3P10071 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GLI3P10071 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GLI3P10071 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GLI3P10071 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GLI3P10071 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
GLI3P10071 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GLI3P10071 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GLI3P10071 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI3P10071 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI3P10071 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI3P10071 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GLI3P10071 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI3P10071 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI3P10071 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI3P10071 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GLI3P10071 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI3P10071 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI3P10071 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GLI3P10071 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI3P10071 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GLI3P10071 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI3P10071 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GLI3P10071 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GLI3P10071 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GLI3P10071 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI3P10071 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI3P10071 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GLI3P10071 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GLI3P10071 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI3P10071 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI3P10071 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
GLI3P10071 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI3P10071 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI3P10071 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GLI3P10071 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI3P10071 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI3P10071 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GLI3P10071 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI3P10071 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GLI3P10071 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI3P10071 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GLI3P10071 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GLI3P10071 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI3P10071 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI3P10071 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GLI3P10071 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI3P10071 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GLI3P10071 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI3P10071 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI3P10071 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GLI3P10071 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GLI3P10071 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GLI3P10071 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI3P10071 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms