Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM225BP0DP42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM225BP0DP42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM225BP0DP42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM225BP0DP42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM225BP0DP42 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms