Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRR23D2P0DMB1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRR23D2P0DMB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23D2P0DMB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR23D2P0DMB1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR23D2P0DMB1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR23D2P0DMB1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms