Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP1-4P0C5Y4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-4P0C5Y4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms