Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
C4AP0C0L4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
C4AP0C0L4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
C4AP0C0L4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
C4AP0C0L4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
C4AP0C0L4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
C4AP0C0L4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
C4AP0C0L4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
C4AP0C0L4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
C4AP0C0L4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
C4AP0C0L4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C4AP0C0L4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
C4AP0C0L4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
C4AP0C0L4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms