Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HOXB7P09629 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HOXB7P09629 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HOXB7P09629 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HOXB7P09629 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HOXB7P09629 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HOXB7P09629 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HOXB7P09629 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HOXB7P09629 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HOXB7P09629 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HOXB7P09629 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HOXB7P09629 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HOXB7P09629 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HOXB7P09629 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HOXB7P09629 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HOXB7P09629 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HOXB7P09629 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HOXB7P09629 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HOXB7P09629 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
HOXB7P09629 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HOXB7P09629 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
HOXB7P09629 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
HOXB7P09629 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.76■■■■□ 3
HOXB7P09629 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
HOXB7P09629 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HOXB7P09629 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HOXB7P09629 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
HOXB7P09629 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HOXB7P09629 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HOXB7P09629 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms