Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD3P08294 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD3P08294 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD3P08294 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD3P08294 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD3P08294 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD3P08294 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD3P08294 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD3P08294 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD3P08294 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD3P08294 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD3P08294 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD3P08294 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD3P08294 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD3P08294 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD3P08294 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD3P08294 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD3P08294 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD3P08294 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD3P08294 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD3P08294 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD3P08294 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD3P08294 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD3P08294 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD3P08294 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD3P08294 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOD3P08294 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOD3P08294 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOD3P08294 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOD3P08294 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOD3P08294 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOD3P08294 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOD3P08294 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOD3P08294 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOD3P08294 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOD3P08294 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOD3P08294 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOD3P08294 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOD3P08294 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOD3P08294 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOD3P08294 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOD3P08294 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOD3P08294 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOD3P08294 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOD3P08294 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOD3P08294 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOD3P08294 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOD3P08294 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOD3P08294 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOD3P08294 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOD3P08294 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD3P08294 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD3P08294 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD3P08294 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD3P08294 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD3P08294 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD3P08294 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD3P08294 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD3P08294 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD3P08294 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD3P08294 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD3P08294 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD3P08294 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD3P08294 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD3P08294 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD3P08294 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD3P08294 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD3P08294 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD3P08294 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD3P08294 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD3P08294 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD3P08294 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD3P08294 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD3P08294 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD3P08294 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD3P08294 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms