Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN3P07498 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN3P07498 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN3P07498 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN3P07498 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN3P07498 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSN3P07498 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN3P07498 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN3P07498 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN3P07498 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN3P07498 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN3P07498 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSN3P07498 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSN3P07498 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSN3P07498 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN3P07498 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN3P07498 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSN3P07498 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CSN3P07498 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSN3P07498 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSN3P07498 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSN3P07498 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSN3P07498 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSN3P07498 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSN3P07498 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSN3P07498 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSN3P07498 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSN3P07498 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN3P07498 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN3P07498 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN3P07498 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN3P07498 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN3P07498 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSN3P07498 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSN3P07498 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN3P07498 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN3P07498 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN3P07498 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN3P07498 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSN3P07498 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSN3P07498 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSN3P07498 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSN3P07498 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSN3P07498 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN3P07498 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSN3P07498 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN3P07498 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN3P07498 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN3P07498 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN3P07498 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN3P07498 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSN3P07498 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN3P07498 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN3P07498 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN3P07498 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN3P07498 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN3P07498 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSN3P07498 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSN3P07498 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSN3P07498 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSN3P07498 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSN3P07498 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSN3P07498 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSN3P07498 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSN3P07498 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSN3P07498 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSN3P07498 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSN3P07498 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN3P07498 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN3P07498 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN3P07498 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSN3P07498 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSN3P07498 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSN3P07498 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms