Protein–RNA interactions for Protein: P07478

PRSS2, Trypsin-2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS2P07478 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRSS2P07478 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRSS2P07478 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRSS2P07478 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRSS2P07478 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms