Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBBP07437 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBBP07437 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBBP07437 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBBP07437 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBBP07437 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBBP07437 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBBP07437 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBBP07437 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBBP07437 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBBP07437 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBBP07437 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBBP07437 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBBP07437 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBBP07437 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBBP07437 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBBP07437 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBBP07437 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBBP07437 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBBP07437 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBBP07437 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBBP07437 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBBP07437 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBBP07437 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBBP07437 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBBP07437 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBBP07437 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBBP07437 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBBP07437 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBBP07437 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBBP07437 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBBP07437 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBBP07437 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBBP07437 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBBP07437 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBBP07437 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBBP07437 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBBP07437 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBBP07437 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBBP07437 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBBP07437 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBBP07437 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBBP07437 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBBP07437 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBBP07437 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBBP07437 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBBP07437 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBBP07437 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBBP07437 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBBP07437 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBBP07437 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBBP07437 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBBP07437 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBBP07437 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBBP07437 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBBP07437 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBBP07437 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBBP07437 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBBP07437 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBBP07437 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBBP07437 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBBP07437 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBBP07437 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBBP07437 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBBP07437 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBBP07437 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBBP07437 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBBP07437 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBBP07437 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBBP07437 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBBP07437 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBBP07437 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBBP07437 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBBP07437 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBBP07437 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBBP07437 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBBP07437 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBBP07437 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBBP07437 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBBP07437 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBBP07437 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBBP07437 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBBP07437 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBBP07437 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBBP07437 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBBP07437 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBBP07437 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms