Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D2O95562 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D2O95562 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D2O95562 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D2O95562 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D2O95562 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D2O95562 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D2O95562 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms