Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNGR4O95473 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNGR4O95473 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGR4O95473 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR4O95473 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms