Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SLIT2O94813 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SLIT2O94813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLIT2O94813 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLIT2O94813 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SLIT2O94813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SLIT2O94813 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SLIT2O94813 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLIT2O94813 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SLIT2O94813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SLIT2O94813 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SLIT2O94813 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SLIT2O94813 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SLIT2O94813 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SLIT2O94813 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SLIT2O94813 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SLIT2O94813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SLIT2O94813 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SLIT2O94813 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SLIT2O94813 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SLIT2O94813 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SLIT2O94813 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SLIT2O94813 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SLIT2O94813 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SLIT2O94813 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SLIT2O94813 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SLIT2O94813 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SLIT2O94813 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SLIT2O94813 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SLIT2O94813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms