Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BBOX1O75936 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BBOX1O75936 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BBOX1O75936 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BBOX1O75936 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BBOX1O75936 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BBOX1O75936 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BBOX1O75936 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms