Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRP5O75197 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRP5O75197 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRP5O75197 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRP5O75197 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRP5O75197 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRP5O75197 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRP5O75197 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRP5O75197 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRP5O75197 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRP5O75197 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRP5O75197 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRP5O75197 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRP5O75197 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRP5O75197 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRP5O75197 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRP5O75197 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRP5O75197 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LRP5O75197 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRP5O75197 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LRP5O75197 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LRP5O75197 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRP5O75197 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRP5O75197 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRP5O75197 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRP5O75197 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRP5O75197 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRP5O75197 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRP5O75197 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRP5O75197 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRP5O75197 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRP5O75197 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRP5O75197 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRP5O75197 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRP5O75197 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRP5O75197 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRP5O75197 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRP5O75197 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRP5O75197 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRP5O75197 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRP5O75197 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRP5O75197 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRP5O75197 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRP5O75197 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRP5O75197 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRP5O75197 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRP5O75197 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRP5O75197 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRP5O75197 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LRP5O75197 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRP5O75197 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRP5O75197 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRP5O75197 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRP5O75197 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRP5O75197 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRP5O75197 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRP5O75197 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRP5O75197 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRP5O75197 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRP5O75197 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRP5O75197 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRP5O75197 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRP5O75197 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRP5O75197 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRP5O75197 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRP5O75197 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRP5O75197 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
LRP5O75197 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRP5O75197 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRP5O75197 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRP5O75197 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRP5O75197 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRP5O75197 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRP5O75197 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
LRP5O75197 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRP5O75197 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRP5O75197 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRP5O75197 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRP5O75197 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRP5O75197 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRP5O75197 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRP5O75197 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRP5O75197 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRP5O75197 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRP5O75197 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRP5O75197 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRP5O75197 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRP5O75197 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRP5O75197 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LRP5O75197 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRP5O75197 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRP5O75197 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRP5O75197 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRP5O75197 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRP5O75197 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms