Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM4AO75164 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KDM4AO75164 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
KDM4AO75164 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KDM4AO75164 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM4AO75164 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
KDM4AO75164 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM4AO75164 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM4AO75164 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM4AO75164 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KDM4AO75164 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KDM4AO75164 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KDM4AO75164 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms