Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD2O60906 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMPD2O60906 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD2O60906 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD2O60906 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD2O60906 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms