Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPXNO60711 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPXNO60711 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPXNO60711 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPXNO60711 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LPXNO60711 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LPXNO60711 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LPXNO60711 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LPXNO60711 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LPXNO60711 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LPXNO60711 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LPXNO60711 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LPXNO60711 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LPXNO60711 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPXNO60711 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPXNO60711 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPXNO60711 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPXNO60711 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LPXNO60711 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPXNO60711 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPXNO60711 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPXNO60711 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPXNO60711 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LPXNO60711 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LPXNO60711 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LPXNO60711 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LPXNO60711 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LPXNO60711 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LPXNO60711 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LPXNO60711 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPXNO60711 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPXNO60711 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPXNO60711 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LPXNO60711 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPXNO60711 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPXNO60711 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPXNO60711 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LPXNO60711 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LPXNO60711 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPXNO60711 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPXNO60711 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPXNO60711 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LPXNO60711 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LPXNO60711 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LPXNO60711 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LPXNO60711 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LPXNO60711 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LPXNO60711 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LPXNO60711 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPXNO60711 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPXNO60711 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms