Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD1O60671 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD1O60671 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD1O60671 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD1O60671 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD1O60671 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD1O60671 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD1O60671 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD1O60671 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD1O60671 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD1O60671 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD1O60671 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD1O60671 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD1O60671 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD1O60671 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD1O60671 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD1O60671 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD1O60671 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD1O60671 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD1O60671 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD1O60671 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD1O60671 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD1O60671 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD1O60671 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD1O60671 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD1O60671 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD1O60671 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD1O60671 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD1O60671 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD1O60671 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD1O60671 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD1O60671 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD1O60671 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD1O60671 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD1O60671 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD1O60671 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD1O60671 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD1O60671 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD1O60671 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD1O60671 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD1O60671 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD1O60671 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD1O60671 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD1O60671 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD1O60671 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD1O60671 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD1O60671 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD1O60671 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD1O60671 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD1O60671 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD1O60671 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD1O60671 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD1O60671 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD1O60671 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD1O60671 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD1O60671 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD1O60671 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD1O60671 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD1O60671 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD1O60671 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD1O60671 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD1O60671 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD1O60671 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD1O60671 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD1O60671 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD1O60671 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD1O60671 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD1O60671 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD1O60671 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD1O60671 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD1O60671 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD1O60671 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD1O60671 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD1O60671 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD1O60671 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD1O60671 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD1O60671 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD1O60671 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD1O60671 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD1O60671 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD1O60671 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD1O60671 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD1O60671 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD1O60671 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms