Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD6O60522 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD6O60522 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TDRD6O60522 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TDRD6O60522 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD6O60522 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms