Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF1CO43896 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF1CO43896 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF1CO43896 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF1CO43896 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIF1CO43896 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms