Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCO2O43819 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCO2O43819 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCO2O43819 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCO2O43819 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCO2O43819 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCO2O43819 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCO2O43819 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCO2O43819 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCO2O43819 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCO2O43819 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCO2O43819 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCO2O43819 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCO2O43819 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCO2O43819 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCO2O43819 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCO2O43819 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCO2O43819 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCO2O43819 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCO2O43819 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCO2O43819 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCO2O43819 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCO2O43819 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCO2O43819 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCO2O43819 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCO2O43819 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCO2O43819 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCO2O43819 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCO2O43819 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCO2O43819 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCO2O43819 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCO2O43819 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCO2O43819 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCO2O43819 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCO2O43819 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCO2O43819 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCO2O43819 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCO2O43819 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCO2O43819 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCO2O43819 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCO2O43819 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCO2O43819 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCO2O43819 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCO2O43819 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCO2O43819 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCO2O43819 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCO2O43819 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCO2O43819 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCO2O43819 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCO2O43819 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCO2O43819 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCO2O43819 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCO2O43819 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCO2O43819 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCO2O43819 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCO2O43819 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCO2O43819 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCO2O43819 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCO2O43819 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCO2O43819 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCO2O43819 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCO2O43819 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCO2O43819 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCO2O43819 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCO2O43819 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCO2O43819 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCO2O43819 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCO2O43819 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCO2O43819 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCO2O43819 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCO2O43819 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCO2O43819 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCO2O43819 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCO2O43819 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCO2O43819 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCO2O43819 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCO2O43819 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCO2O43819 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCO2O43819 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCO2O43819 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCO2O43819 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCO2O43819 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCO2O43819 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1260.9 ms