Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LANCL1O43813 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LANCL1O43813 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LANCL1O43813 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LANCL1O43813 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LANCL1O43813 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms