Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRPF3O43395 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRPF3O43395 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRPF3O43395 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRPF3O43395 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPF3O43395 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPF3O43395 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPF3O43395 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms