Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP8O43159 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP8O43159 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP8O43159 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP8O43159 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP8O43159 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP8O43159 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP8O43159 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP8O43159 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP8O43159 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP8O43159 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP8O43159 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP8O43159 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP8O43159 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP8O43159 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP8O43159 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP8O43159 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP8O43159 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP8O43159 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP8O43159 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP8O43159 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP8O43159 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP8O43159 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP8O43159 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP8O43159 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP8O43159 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP8O43159 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP8O43159 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP8O43159 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP8O43159 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP8O43159 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP8O43159 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP8O43159 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP8O43159 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP8O43159 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP8O43159 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP8O43159 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP8O43159 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP8O43159 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP8O43159 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP8O43159 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP8O43159 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP8O43159 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP8O43159 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP8O43159 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP8O43159 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP8O43159 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP8O43159 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP8O43159 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP8O43159 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP8O43159 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP8O43159 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP8O43159 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP8O43159 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP8O43159 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP8O43159 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP8O43159 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP8O43159 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP8O43159 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP8O43159 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP8O43159 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP8O43159 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP8O43159 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP8O43159 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP8O43159 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP8O43159 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP8O43159 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP8O43159 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP8O43159 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP8O43159 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP8O43159 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP8O43159 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP8O43159 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP8O43159 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP8O43159 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP8O43159 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP8O43159 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP8O43159 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP8O43159 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP8O43159 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP8O43159 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP8O43159 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP8O43159 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP8O43159 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP8O43159 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP8O43159 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP8O43159 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP8O43159 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP8O43159 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRP8O43159 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP8O43159 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP8O43159 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP8O43159 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP8O43159 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP8O43159 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP8O43159 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP8O43159 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP8O43159 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP8O43159 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP8O43159 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms