Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PODXLO00592 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PODXLO00592 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PODXLO00592 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PODXLO00592 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PODXLO00592 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PODXLO00592 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PODXLO00592 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PODXLO00592 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PODXLO00592 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PODXLO00592 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PODXLO00592 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PODXLO00592 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PODXLO00592 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PODXLO00592 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXLO00592 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXLO00592 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXLO00592 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXLO00592 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXLO00592 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXLO00592 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXLO00592 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXLO00592 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PODXLO00592 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PODXLO00592 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PODXLO00592 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXLO00592 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXLO00592 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXLO00592 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXLO00592 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXLO00592 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXLO00592 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXLO00592 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXLO00592 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXLO00592 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXLO00592 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXLO00592 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXLO00592 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXLO00592 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXLO00592 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXLO00592 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXLO00592 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXLO00592 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXLO00592 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PODXLO00592 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXLO00592 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXLO00592 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXLO00592 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXLO00592 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXLO00592 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXLO00592 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXLO00592 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXLO00592 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXLO00592 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXLO00592 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXLO00592 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXLO00592 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXLO00592 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXLO00592 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXLO00592 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXLO00592 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXLO00592 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXLO00592 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXLO00592 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PODXLO00592 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PODXLO00592 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PODXLO00592 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXLO00592 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PODXLO00592 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXLO00592 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PODXLO00592 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PODXLO00592 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PODXLO00592 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXLO00592 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXLO00592 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PODXLO00592 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PODXLO00592 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PODXLO00592 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXLO00592 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PODXLO00592 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXLO00592 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXLO00592 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PODXLO00592 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PODXLO00592 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXLO00592 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXLO00592 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PODXLO00592 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXLO00592 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXLO00592 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PODXLO00592 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PODXLO00592 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PODXLO00592 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PODXLO00592 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PODXLO00592 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PODXLO00592 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PODXLO00592 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PODXLO00592 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PODXLO00592 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PODXLO00592 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PODXLO00592 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms