Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFRD1O00458 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFRD1O00458 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IFRD1O00458 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFRD1O00458 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFRD1O00458 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms