Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3QKU1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3QKU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3QKU1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3QKU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3QKU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3QKU1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3QKU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
J3QKU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
J3QKU1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QKU1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QKU1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QKU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QKU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QKU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QKU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QKU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QKU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QKU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QKU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QKU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QKU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QKU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
J3QKU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
J3QKU1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
J3QKU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QKU1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3QKU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3QKU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3QKU1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3QKU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
J3QKU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3QKU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3QKU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QKU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QKU1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QKU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QKU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3QKU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QKU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QKU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QKU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QKU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QKU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QKU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3QKU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3QKU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3QKU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
J3QKU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QKU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QKU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QKU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QKU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QKU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3QKU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
J3QKU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QKU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QKU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3QKU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3QKU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
J3QKU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
J3QKU1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
J3QKU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QKU1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QKU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QKU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QKU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QKU1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QKU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QKU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QKU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QKU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QKU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QKU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QKU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3QKU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3QKU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QKU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QKU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QKU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
J3QKU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3QKU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QKU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QKU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QKU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QKU1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QKU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3QKU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3QKU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3QKU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3QKU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3QKU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3QKU1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QKU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QKU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QKU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QKU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QKU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QKU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3QKU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms