Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H7C1H1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H7C1H1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H7C1H1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H7C1H1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H7C1H1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H7C1H1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H7C1H1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H7C1H1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H7C1H1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H7C1H1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H7C1H1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C1H1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C1H1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C1H1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C1H1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C1H1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C1H1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
H7C1H1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H7C1H1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H7C1H1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H7C1H1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H7C1H1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H7C1H1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H7C1H1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H7C1H1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H7C1H1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H7C1H1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H7C1H1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H7C1H1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H7C1H1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H7C1H1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H7C1H1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H7C1H1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H7C1H1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H7C1H1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H7C1H1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H7C1H1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H7C1H1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H7C1H1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H7C1H1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H7C1H1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H7C1H1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H7C1H1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H7C1H1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H7C1H1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H7C1H1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H7C1H1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H7C1H1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H7C1H1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H7C1H1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H7C1H1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H7C1H1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H7C1H1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H7C1H1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H7C1H1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H7C1H1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H7C1H1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H7C1H1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H7C1H1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H7C1H1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H7C1H1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H7C1H1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H7C1H1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H7C1H1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H7C1H1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H7C1H1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H7C1H1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H7C1H1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H7C1H1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H7C1H1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H7C1H1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H7C1H1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H7C1H1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H7C1H1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H7C1H1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H7C1H1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H7C1H1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H7C1H1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H7C1H1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H7C1H1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H7C1H1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H7C1H1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H7C1H1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H7C1H1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H7C1H1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H7C1H1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H7C1H1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms