Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BNC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BNC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BNC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H3BNC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BNC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BNC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
H3BNC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H3BNC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BNC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BNC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BNC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BNC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BNC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BNC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BNC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BNC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BNC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BNC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BNC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BNC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BNC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BNC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BNC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BNC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BNC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BNC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BNC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BNC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H3BNC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
H3BNC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BNC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BNC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BNC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BNC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BNC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BNC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BNC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BNC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BNC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BNC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BNC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BNC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BNC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BNC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
H3BNC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H3BNC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BNC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BNC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BNC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BNC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H3BNC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H3BNC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H3BNC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
H3BNC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BNC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BNC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BNC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BNC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BNC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BNC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BNC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BNC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BNC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BNC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BNC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H3BNC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H3BNC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H3BNC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BNC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BNC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BNC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BNC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
H3BNC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H3BNC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H3BNC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BNC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BNC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BNC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BNC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BNC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BNC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BNC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BNC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BNC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BNC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BNC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H3BNC9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
H3BNC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BNC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BNC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms