Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP4-16G5E9R7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP4-16G5E9R7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP4-16G5E9R7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms