Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.06■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.02■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms