Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PQ18 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PQ18 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PQ18 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PQ18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PQ18 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PQ18 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PQ18 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PQ18 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PQ18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PQ18 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PQ18 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PQ18 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PQ18 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PQ18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PQ18 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PQ18 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PQ18 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PQ18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PQ18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PQ18 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PQ18 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PQ18 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PQ18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PQ18 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PQ18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PQ18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PQ18 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PQ18 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PQ18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PQ18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PQ18 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PQ18 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PQ18 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PQ18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PQ18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PQ18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PQ18 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PQ18 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PQ18 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PQ18 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PQ18 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PQ18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PQ18 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PQ18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PQ18 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PQ18 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PQ18 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PQ18 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PQ18 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PQ18 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PQ18 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PQ18 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PQ18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PQ18 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PQ18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PQ18 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PQ18 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PQ18 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PQ18 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PQ18 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PQ18 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PQ18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PQ18 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PQ18 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PQ18 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PQ18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PQ18 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PQ18 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PQ18 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PQ18 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PQ18 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PQ18 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PQ18 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E9PQ18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E9PQ18 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PQ18 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PQ18 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PQ18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PQ18 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PQ18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PQ18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PQ18 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PQ18 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PQ18 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PQ18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PQ18 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PQ18 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms