Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQCJ-SCHIP1C9J366 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQCJ-SCHIP1C9J366 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IQCJ-SCHIP1C9J366 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms