Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDZK1P1A8MUH7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZK1P1A8MUH7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZK1P1A8MUH7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDZK1P1A8MUH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1P1A8MUH7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms