Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM223BA6NKX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM223BA6NKX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM223BA6NKX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM223BA6NKX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM223BA6NKX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms