Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACOD1A6NK06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACOD1A6NK06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACOD1A6NK06 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACOD1A6NK06 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACOD1A6NK06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACOD1A6NK06 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms