Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L9A6NEM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA6L9A6NEM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA6L9A6NEM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms